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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2z66A_ | PDB header: immune system | Chain: A: PDB Molecule: variable lymphocyte receptor b, toll-like receptor 4; | PDBTitle: crystal structure of the vt3 hybrid of human tlr4 and hagfish vlrb.61 |
Added to library: Tue Mar 16 13:45:28 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | C | P | S | R | C | S | C | S | G | T | E | I | R | C | N | S | K | G | L | T | S | V | P | T | G | I | P | S | S | A | T | R | L | E | L | E | S | N | K | L | Q | S | L | P | H | G | V | F | D | K | L | T | Q | L | T | K | L | S | L | S | S | N | G | L | S | F | K | G | C | C |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | S | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | Q | S | D | F | G | T | T | S | L | K | Y | L | D | L | S | F | N | G | V | I | T | M | S | S | N | F | L | G | L | E | Q | L | E | H | L | D | F | Q | H | S | N | L | K | Q | M | S | E | F | S | V | F | L | S | L | R | N | L | I | Y | L | D | I | S | H | T | H | T | R | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | T | T | T | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | F | N | G | I | F | N | G | L | S | S | L | E | V | L | K | M | A | G | N | S | F | Q | E | N | F | L | P | D | I | F | T | E | L | R | N | L | T | F | L | D | L | S | Q | C | Q | L | E | Q | L | S | P | T | A | F | N | S | L | S | S | L | Q | V | L | N | M | S | H | N | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | G | G | G | S | T | T | T | T | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | F | F | S | L | D | T | F | P | Y | K | C | L | N | S | L | Q | V | L | D | Y | S | L | N | H | I | M | T | S | K | K | Q | E | L | Q | H | F | P | S | S | L | A | F | L | N | L | T | Q | N | D | F | A | C | T | C | E | H | Q | S | F | L | Q | W | I | K | D | Q | R | Q | L | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | S | G | G | G | T | T | T | T | T | T | S | B | S | S | S | S | T | T | T | T | S | G | G | G | T | G | G | G | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||
Sequence | V | E | V | E | R | M | E | C | A | T | P | S | D | K | Q | G | M | P | V | L | S | L | N | I | T | C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | B | S | G | G | G | T | T | B | G | G | G |
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