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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2z1mC_ | PDB header: lyase | Chain: C: PDB Molecule: gdp-d-mannose dehydratase; | PDBTitle: crystal structure of gdp-d-mannose dehydratase from aquifex2 aeolicus vf5 |
Added to library: Tue Mar 16 13:20:35 2010 | |
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Sequence | G | K | R | A | L | I | T | G | I | R | G | Q | D | G | A | Y | L | A | K | L | L | L | E | K | G | Y | E | V | Y | G | A | D | S | W | R | L | K | E | L | G | I | E | N | D | V | K | I | I | H | M | D | L | L | E | F | S | N | I | I | R | T | I | E | K | V | Q | P | D | E | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Y | N | L | A | A | Q | S | F | V | G | V | S | F | E | Q | P | I | L | T | A | E | V | D | A | I | G | V | L | R | I | L | E | A | L | R | T | V | K | P | D | T | K | F | Y | Q | A | S | T | S | E | M | F | G | K | V | Q | E | I | P | Q | T | E | K | T | P | F | Y | P | R | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | G | G | G | T | S | S | S | S | S | B | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | P | Y | A | V | A | K | L | F | G | H | W | I | T | V | N | Y | R | E | A | Y | N | M | F | A | C | S | G | I | L | F | N | H | E | S | P | L | R | G | I | E | F | V | T | R | K | I | T | Y | S | L | A | R | I | K | Y | G | L | Q | D | K | L | V | L | G | N | L | N | A | K | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | T | T | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | D | W | G | Y | A | P | E | Y | V | E | A | M | W | L | M | M | Q | Q | P | E | P | D | D | Y | V | I | A | T | G | E | T | H | T | V | R | E | F | V | E | K | A | A | K | I | A | G | F | D | I | E | W | V | G | E | G | I | N | E | K | G | I | D | R | N | T | G | K | V | I | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | S | S | T | S | S | G | G | G | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . |
Sequence | E | V | S | E | E | F | F | R | P | A | E | V | D | I | L | V | G | N | P | E | K | A | M | K | K | L | G | W | K | P | R | T | T | F | D | E | L | V | E | I | M | M | E | A | D | L | K | R | V | R | D | R | E | V | S | V | ||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | B | S | T | S |
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