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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2z0vA_ | PDB header: endocytosis | Chain: A: PDB Molecule: sh3-containing grb2-like protein 3; | PDBTitle: crystal structure of bar domain of endophilin-iii |
Added to library: Tue Mar 16 13:59:34 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | D | D | E | F | L | D | X | E | R | K | I | D | V | T | N | K | V | V | A | E | I | L | S | K | T | T | E | Y | L | Q | P | N | P | A | Y | R | A | K | L | G | X | L | N | T | V | S | K | I | R | G | Q | V | K | T | T | G | Y | P | Q | T | E | G | L | L | G | D | C | X | L | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Y | G | K | E | L | G | E | D | S | T | F | G | N | A | L | I | E | V | G | E | S | X | K | L | X | A | E | V | K | D | S | L | D | I | N | V | K | Q | T | F | I | D | P | L | Q | L | L | Q | D | K | D | L | K | E | I | G | H | H | L | K | K | L | E | G | R | R | L | D | Y | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Y | K | K | K | R | V | G | K | I | P | D | E | E | V | R | Q | A | V | E | K | F | E | E | S | K | E | L | A | E | R | S | X | F | N | F | L | E | N | D | V | E | Q | V | S | Q | L | A | V | F | I | E | A | A | L | D | Y | H | R | Q | S | T | E | I | L | Q | E | L | Q | S | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | L | Q | X | R | I | S | A | A | S | S | V | P | R | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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