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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2z0qA_ | PDB header: signaling protein | Chain: A: PDB Molecule: rho guanine nucleotide exchange factor 3; | PDBTitle: crystal structure of dh-ph domain of rhogef3(xpln) |
Added to library: Tue Mar 16 11:54:40 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | Q | V | L | T | A | K | E | I | K | R | Q | E | A | I | F | E | L | S | Q | G | E | E | D | L | I | E | D | L | K | L | A | K | K | A | Y | H | D | P | X | L | K | L | S | I | X | T | E | Q | E | L | N | Q | I | F | G | T | L | D | S | L | I | P | L | H | E | E | L | L | S | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | R | D | V | R | K | P | D | G | S | T | E | H | V | G | P | I | L | V | G | W | L | P | C | L | S | S | Y | D | S | Y | C | S | N | Q | V | A | A | K | A | L | L | D | H | K | K | Q | D | H | R | V | Q | D | F | D | L | W | N | F | L | D | I | P | R | S | R | L | V | K | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | G | G | G | G | G | T | T | T | T | T | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | P | L | L | L | R | E | I | L | R | H | T | P | N | D | N | P | D | Q | Q | H | L | E | E | A | I | N | I | I | Q | G | I | V | A | E | I | N | T | K | T | G | E | S | E | C | R | Y | Y | K | E | R | L | L | Y | L | E | E | G | Q | K | D | S | L | I | D | S | S | R | V | L | C |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | S | T | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | C | H | G | E | L | K | N | N | R | G | V | K | L | H | V | F | L | F | Q | E | V | L | V | I | T | R | A | V | T | H | N | E | Q | L | C | Y | Q | L | Y | R | Q | P | I | P | V | K | D | L | T | L | E | D | L | Q | D | G | E | V | R | L | G | G | S | L | A | F | S | N | N | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | T | T | S | S | G | G | G | T | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | ||||||||||
Sequence | R | V | K | N | F | F | R | V | S | F | K | N | G | S | Q | S | Q | T | H | S | L | Q | A | N | D | T | F | N | K | Q | Q | W | L | N | C | I | R | Q | A | K | E | |||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | G | G | G | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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