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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2yt1A_ | PDB header: protein binding | Chain: A: PDB Molecule: amyloid beta a4 protein and amyloid beta a4 | PDBTitle: solution structure of the chimera of the c-terminal tail2 peptide of app and the c-terminal pid domain of fe65l |
Added to library: Tue Mar 16 14:21:22 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | S | S | G | S | S | G | D | A | A | V | T | P | E | E | R | H | L | S | K | M | Q | Q | N | G | Y | E | N | P | T | Y | K | F | F | E | Q | M | Q | N | S | G | P | S | S | G | I | E | G | R | G | S | S | G | S | S | G | S | S | G | S | S | G | P | T | P | K | T | E | L | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | S | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Q | K | F | R | V | Q | Y | L | G | M | L | P | V | D | R | P | V | G | M | D | T | L | N | S | A | I | E | N | L | M | T | S | S | S | K | E | D | W | P | S | V | N | M | N | V | A | D | A | T | V | T | V | I | S | E | K | N | E | E | E | V | L | V | E | C | R | V | R | F | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | T | S | T | T | S | S | S | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | ||||||
Sequence | S | F | M | G | V | G | K | D | V | H | T | F | A | F | I | M | D | T | G | N | Q | R | F | E | C | H | V | F | W | C | E | P | N | A | A | N | V | S | E | A | V | Q | A | A | C | |||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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