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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2yrqA_ | PDB header: dna binding protein | Chain: A: PDB Molecule: high mobility group protein b1; | PDBTitle: solution structure of the tandem hmg box domain from human2 high mobility group protein b1 |
Added to library: Tue Mar 16 12:39:10 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | S | S | G | S | S | G | M | G | K | G | D | P | K | K | P | R | G | K | M | S | S | Y | A | F | F | V | Q | T | C | R | E | E | H | K | K | K | H | P | D | A | S | V | N | F | S | E | F | S | K | K | C | S | E | R | W | K | T | M | S | A | K | E | K | G | K | F | E | D | M |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | K | A | D | K | A | R | Y | E | R | E | M | K | T | Y | I | P | P | K | G | E | T | K | K | K | F | K | D | P | N | A | P | K | R | P | P | S | A | F | F | L | F | C | S | E | Y | R | P | K | I | K | G | E | H | P | G | L | S | I | G | D | V | A | K | K | L | G | E | M | W |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||
Sequence | N | N | T | A | A | D | D | K | Q | P | Y | E | K | K | A | A | K | L | K | E | K | Y | E | K | D | I | A | A | Y | R | A | K | G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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