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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2yq2A_ | PDB header: viral protein | Chain: A: PDB Molecule: bvdv1 e2; | PDBTitle: structure of bvdv1 envelope glycoprotein e2, ph8 |
Added to library: Tue Jan 22 09:00:43 2013 | |
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Sequence | T | G | C | K | P | E | Y | Y | Y | A | I | A | K | N | D | R | I | G | P | L | G | A | E | G | L | T | T | V | W | K | D | Y | S | P | E | M | T | L | E | D | T | M | V | I | A | S | C | R | D | G | K | F | M | Y | L | S | R | C | T | R | E | T | R | Y | L | A | I | L | H | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | S | T | T | S | B | S | S | T | T | S | S | S | S | S | B | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | R | A | L | P | T | S | V | V | F | K | K | L | F | E | G | Q | K | Q | G | D | T | V | E | M | D | D | D | F | E | F | G | L | C | P | C | D | A | K | P | I | V | R | G | K | Y | N | T | T | L | L | N | G | P | A | F | Q | M | V | C | P | I | G | W | T | G | T | V | S | C | M |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | G | G | G | S | T | T | G | G | G | S | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | A | N | R | D | T | L | D | T | A | V | V | R | T | Y | R | R | S | R | P | F | P | Y | R | Q | G | C | I | T | Q | K | V | L | G | E | D | L | Y | D | C | I | L | G | G | N | W | T | C | V | T | G | D | Q | L | Q | Y | S | G | G | S | I | E | S | C | K | W | C | G | F | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | S | T | T | G | G | G | B | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | F | Q | R | S | E | G | L | P | H | Y | P | I | G | K | C | R | L | K | N | E | T | G | Y | R | L | V | D | N | T | S | C | N | R | E | G | V | A | I | V | P | Q | G | T | V | K | C | K | I | G | D | T | T | V | Q | V | I | A | L | D | T | K | L | G | P | M | P | C | K | P | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | T | T | S | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . |
Sequence | E | I | I | S | S | E | G | P | V | E | K | T | A | C | T | F | N | Y | T | K | T | L | K | N | K | Y | F | E | P | R | D | S | Y | F | Q | Q | Y | M | L | K | G | E | Y | Q | Y | W | F | D | L | E | V | T | ||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T | T | S | S | T | T | T | S | S | T | T |
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