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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2ynbA_ | PDB header: hydrolase | Chain: A: PDB Molecule: 3c-like proteinase; | PDBTitle: crystal structure of the main protease of coronavirus hku42 in complex with a michael acceptor sg85 |
Added to library: Sat Oct 26 08:23:37 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | G | L | V | K | M | S | A | P | S | G | A | V | E | N | C | I | V | Q | V | T | C | G | S | M | T | L | N | G | L | W | L | D | N | T | V | W | C | P | R | H | I | M | C | P | A | D | Q | L | T | D | P | N | Y | D | A | L | L | I | S | K | T | N | H | S | F | I | V | Q | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | G | G | G | G | S | T | T | S | S | T | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | H | I | G | A | Q | A | N | L | R | V | V | A | H | S | M | V | G | V | L | L | K | L | T | V | D | V | A | N | P | S | T | P | A | Y | T | F | S | T | V | K | P | G | A | S | F | S | V | L | A | C | Y | N | G | K | P | T | G | V | F | T | V | N | L | R | H | N | S | T | I | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | G | S | F | L | C | G | S | C | G | S | V | G | Y | T | E | N | G | G | V | I | N | F | V | Y | M | H | Q | M | E | L | S | N | G | T | H | T | G | S | S | F | D | G | V | M | Y | G | A | F | E | D | K | Q | T | H | Q | L | Q | L | T | D | K | Y | C | T | I | N | V | V | A | W |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | B | G | G | G | S | S | S | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | L | Y | A | A | V | L | N | G | C | K | W | F | V | K | P | T | R | V | G | I | V | T | Y | N | E | W | A | L | S | N | Q | F | T | E | F | V | G | T | Q | S | I | D | M | L | A | H | R | T | G | V | S | V | E | Q | M | L | A | A | I | Q | S | L | H | A | G | F | Q | G | K | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | T | B | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | I | L | G | Q | S | T | L | E | D | E | F | T | P | D | D | V | N | M | Q | V | M | G | V | V | M | Q | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | B | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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