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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2yn7A_ | PDB header: membrane protein | Chain: A: PDB Molecule: outer surface protein; | PDBTitle: crystal structure of an outer surface protein bba66 from2 borrelia burgdorferi |
Added to library: Sat Oct 26 08:26:16 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | K | L | Q | T | L | K | N | E | L | I | R | A | I | S | E | E | K | N | K | T | Q | N | N | F | G | F | R | E | T | Y | D | Q | F | K | M | K | D | S | A | F | E | L | L | D | V | I | S | D | R | S | Y | A | P | Q | L | N | S | N | T | P | E | A | E | N | E | R | N | K | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | G | G | G | G | B | G | G | G | B | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Y | A | L | M | D | F | D | Q | Y | K | I | E | Q | F | G | S | I | M | E | A | L | Y | N | E | N | Q | N | H | S | L | I | R | E | L | M | I | S | G | L | G | T | Q | I | S | F | E | L | A | L | E | E | I | N | K | K | I | E | I | F | N | Q | D | Y | L | N | A | K | I | N | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | G | G | G | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | F | D | F | T | M | K | L | K | E | L | K | S | K | L | N | Q | I | L | D | K | R | K | E | W | S | R | Q | A | D | G | L | I | A | N | A | S | S | N | S | S | L | S | D | S | K | S | L | A | E | Y | I | K | K | R | Y | L | D | N | M | Q | N | A | R | Q | S | V | L | E | A | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | G | G | G | S | T |   | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | I | S | I | M | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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