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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2yn5B_ | PDB header: membrane protein | Chain: B: PDB Molecule: putative inner membrane protein; | PDBTitle: structural insight into the giant calcium-binding adhesin siie:2 implications for the adhesion of salmonella enterica to polarized3 epithelial cells |
Added to library: Sat Apr 6 08:35:17 2013 | |
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Sequence | T | P | P | N | A | P | V | V | T | Y | S | D | I | V | N | D | L | I | I | M | Q | G | T | A | E | A | K | S | Q | L | I | I | T | D | S | E | G | N | T | Y | T | L | T | V | P | D | N | G | K | W | S | M | A | I | P | Y | P | S | E | G | K | F | T | I | T | S | V | D | A | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | S | T | T | S | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | N | R | S | D | D | V | P | L | D | I | M | K | E | V | P | V | I | S | L | S | P | D | S | D | S | G | T | V | G | D | N | I | T | R | D | K | Q | P | T | F | I | I | G | N | L | E | S | D | V | V | V | V | Q | V | D | I | N | G | T | V | Y | N | A | E | K | N | A | D | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | G | G | G | S | S | T | T | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | V | W | F | F | T | P | G | T | P | L | A | D | G | S | Y | T | I | S | V | I | A | S | D | A | A | G | N | Q | K | N | S | L | P | I | T | V | T | I | D | S | T | L | T | V | P | E | I | A | L | A | A | G | E | D | N | G | A | S | D | S | D | N | V | T | N | H | T | Q | P | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | T | T | T | S | T | T | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | F | T | L | Q | H | I | D | A | D | V | T | G | V | T | V | N | V | T | H | N | G | V | T | D | I | Y | Q | A | T | Q | G | A | D | G | W | T | F | T | P | P | A | A | W | N | D | G | N | Y | T | L | S | V | T | V | V | D | R | A | G | N | S | Q | Q | S | A | S | L | A | V | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | V | D | S | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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