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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2yf6A_ | PDB header: immune system | Chain: A: PDB Molecule: major histocompatibility complex class i glycoprotein | PDBTitle: complex of a b21 chicken mhc class i molecule and a 10mer2 chicken peptide |
Added to library: Sat Apr 23 08:55:21 2011 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | L | H | T | L | R | Y | I | R | T | A | M | T | D | P | G | P | G | L | P | W | F | V | D | V | G | Y | V | D | G | E | L | F | M | H | Y | N | S | T | A | R | R | A | V | P | R | T | E | W | I | A | A | N | T | D | Q | Q | Y | W | D | R | E | T | Q | I | V | Q | G | S | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | T | T | T | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Q | I | N | R | E | N | L | D | I | L | R | R | R | Y | N | Q | T | G | G | S | H | T | V | Q | W | M | S | G | C | D | I | L | E | D | G | T | I | R | G | Y | H | Q | A | A | Y | D | G | R | D | F | V | A | F | D | K | G | T | M | T | L | T | A | A | V | P | E | A | V | P | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | K | R | K | W | E | E | G | G | Y | A | E | G | L | K | Q | Y | L | E | E | T | C | V | E | W | L | R | R | Y | V | E | Y | G | K | A | E | L | G | R | R | E | R | P | E | V | R | V | W | G | K | E | A | D | G | I | L | T | L | S | C | R | A | H | G | F | Y | P | R | P | I | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | T | B | S | S | S | B | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . |
Sequence | V | S | W | L | K | D | G | A | V | R | G | Q | D | A | Q | S | G | G | I | V | P | N | G | D | G | T | Y | H | T | W | V | T | I | D | A | Q | P | G | D | G | D | K | Y | Q | C | R | V | E | H | A | S | L | P | Q | P | G | L | Y | S | W | R | S | G | G | G | L | ||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | B | T | T | T | T | T | S | T | T | S | T | T | T | T | S | S | T | T | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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