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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2y25C_ | PDB header: structural protein | Chain: C: PDB Molecule: myomesin; | PDBTitle: crystal structure of the myomesin domains my11-my13 |
Added to library: Sun Dec 25 00:17:06 2011 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | I | D | P | F | T | G | P | H | F | V | E | Y | L | S | W | E | V | T | G | E | C | N | V | L | L | K | C | K | V | A | N | I | K | K | E | T | H | I | V | W | Y | K | D | E | R | E | I | S | V | D | E | K | G | I | C | T | L | L | I | T | E | F | S | K | K | D | A | G | I | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | T | S | T | T | T | T | S | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | V | I | L | K | D | D | R | G | K | D | K | S | R | L | K | L | V | D | E | A | F | K | E | L | M | M | E | V | C | K | K | I | A | L | S | A | T | D | L | K | I | Q | S | T | A | E | G | I | Q | L | Y | S | F | V | T | Y | Y | V | E | D | L | K | V | N | W | S | H | N | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | B | S | S | B | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | A | I | R | Y | S | D | R | V | K | T | G | V | T | G | E | Q | I | W | L | Q | I | N | E | P | T | P | N | D | K | G | K | Y | V | M | E | L | F | D | G | K | T | G | H | Q | K | T | V | D | L | S | G | Q | A | Y | D | E | A | Y | A | E | F | Q | R | L | K | Q | A | A | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | S | S | S | S | S | G | G | G | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | A | E | K | N | R | A | R | V | L | G | G | L | P | D | V | V | T | I | Q | E | G | K | A | L | N | L | T | C | N | V | W | G | D | P | P | P | E | V | S | W | L | K | N | E | K | A | L | A | S | D | D | H | C | N | L | K | F | E | A | G | R | T | A | Y | F | T | I | N | G | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | T | T | S | B | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | B | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | ||||||||||||||||||
Sequence | S | T | A | D | S | G | K | Y | G | L | V | V | K | N | K | Y | G | S | E | T | S | D | F | T | V | S | V | F | I | P | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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