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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2y23A_ | PDB header: structural protein | Chain: A: PDB Molecule: myomesin; | PDBTitle: crystal structure of the myomesin domains my9-my11 |
Added to library: Sat Dec 24 23:12:01 2011 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | T | K | E | V | V | V | N | V | D | D | D | G | V | I | S | L | N | F | E | C | D | K | M | T | P | K | S | E | F | S | W | S | K | D | Y | V | S | T | E | D | S | P | R | L | E | V | E | S | K | G | N | K | T | K | M | T | F | K | D | L | G | M | D | D | L | G | I | Y | S | C |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | V | T | D | T | D | G | I | A | S | S | Y | L | I | D | E | E | E | L | K | R | L | L | A | L | S | H | E | H | K | F | P | T | V | P | V | K | S | E | L | A | V | E | I | L | E | K | G | Q | V | R | F | W | M | Q | A | E | K | L | S | G | N | A | K | V | N | Y | I | F | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | B | S | S | S | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | E | K | E | I | F | E | G | P | K | Y | K | M | H | I | D | R | N | T | G | I | I | E | M | F | M | E | K | L | Q | D | E | D | E | G | T | Y | T | F | Q | L | Q | D | G | K | A | T | N | H | S | T | V | V | L | V | G | D | V | F | K | K | L | Q | K | E | A | E | F | Q | R | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | S | T | T | T | T | S | G | G | G | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | E | W | I | R | K | Q | G | P | H | F | V | E | Y | L | S | W | E | V | T | G | E | C | N | V | L | L | K | C | K | V | A | N | I | K | K | E | T | H | I | V | W | Y | K | D | E | R | E | I | S | V | D | E | K | H | G | I | C | T | L | L | I | T | E | F | S | K | K | D | A | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | S | S | S | T | T | S | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | I | Y | E | V | I | L | K | D | D | R | G | K | D | K | S | R | L | K | L | V | D | E | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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