|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c2xznQ_ | PDB header: ribosome | Chain: Q: PDB Molecule: ribosomal protein s17 containing protein; | PDBTitle: crystal structure of the eukaryotic 40s ribosomal2 subunit in complex with initiation factor 1. this file3 contains the 40s subunit and initiation factor for4 molecule 2 |
Added to library: Sat Jan 22 08:44:43 2011 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | M | D | T | Q | I | Q | R | A | Y | Q | K | Q | D | G | V | F | L | N | S | K | K | L | L | A | K | K | T | S | A | G | V | R | Y | Y | K | N | I | G | L | G | F | K | T | P | K | E | A | I | E | G | T | Y | V | D | K | K | C | P | F | T | S | N | L | S | I | R | G | K | I | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | G | G | G | G | G | G | S | S | S | S | S | T | T | T | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | G | L | V | I | S | T | K | M | N | R | T | V | I | I | R | R | D | Y | L | H | Y | V | R | K | Y | N | R | Y | E | K | R | H | R | N | I | P | V | H | I | S | P | C | F | S | V | K | E | G | D | I | L | V | A | G | Q | C | R | P | I | S | K | T | V | R | F | N | A | L | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T | T | T | T | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | V | V | P | N | E | I | I | G | S | V | R | K | Q | F | L | L | F | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|