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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2xroE_ | PDB header: dna-binding protein/dna | Chain: E: PDB Molecule: hth-type transcriptional regulator ttgv; | PDBTitle: crystal structure of ttgv in complex with its dna operator |
Added to library: Sat Dec 11 13:49:50 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | Q | V | I | A | R | A | A | S | I | M | R | A | L | G | S | H | P | H | G | L | S | L | A | A | I | A | Q | L | V | G | L | P | R | S | T | V | Q | R | I | I | N | A | L | E | E | E | F | L | V | E | A | L | G | P | A | G | G | F | R | L | G | P | A | L | G | Q | L | I | N | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | S | S | T | T | T | S | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | Q | T | D | I | L | S | L | V | K | P | Y | L | R | S | L | A | E | E | L | D | E | S | V | S | L | A | S | L | A | G | D | K | I | Y | V | L | D | R | I | V | S | E | R | E | L | R | V | V | F | P | I | G | I | N | V | P | A | A | A | T | A | A | G | K | V | L | L | A | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | T | T | S | S | S | T | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | P | D | E | T | L | Q | A | A | L | G | E | Q | L | P | V | L | T | S | N | T | L | G | R | K | A | L | V | K | Q | L | S | E | V | R | Q | S | G | V | A | S | D | L | D | E | H | I | D | G | V | S | S | F | A | T | L | L | D | T | Y | L | G | Y | Y | S | L | A | I | V | M |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||
Sequence | P | S | S | R | A | S | K | Q | S | D | L | I | K | K | A | L | L | Q | S | K | L | N | I | E | R | A | I | G | R | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T | S | S | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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