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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2xp1A_ | PDB header: transcription | Chain: A: PDB Molecule: spt6; | PDBTitle: structure of the tandem sh2 domains from antonospora locustae2 transcription elongation factor spt6 |
Added to library: Thu Oct 7 14:37:38 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | H | M | K | Y | T | N | P | R | F | Y | K | H | P | L | F | K | N | F | N | V | T | E | S | E | N | Y | L | R | S | S | T | D | D | F | L | I | R | K | G | S | R | H | G | Y | C | V | L | V | I | K | F | A | S | D | V | F | V | H | M | K | I | E | E | H | S | E | H | Y | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | G | G | G | G | S | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | C | S | N | K | H | F | E | D | I | D | E | V | I | S | V | Y | V | R | P | I | L | R | N | L | K | S | I | K | A | H | A | K | Y | F | N | S | P | E | D | A | E | K | L | L | S | S | F | D | G | S | K | V | V | Y | A | F | Y | F | S | R | K | Y | P | G | K | L | T | F | A | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | S | T | T | B | S | T | T | T | S | T | S | S | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | |||||||||||
Sequence | N | N | G | S | I | L | E | E | Y | I | G | V | S | D | M | L | T | Y | N | N | S | T | F | K | D | I | D | S | F | V | A | Y | R | K | R | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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