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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2xb0X_ | PDB header: hydrolase | Chain: X: PDB Molecule: chromo domain-containing protein 1; | PDBTitle: dna-binding domain from saccharomyces cerevisiae chromatin-2 remodelling protein chd1 |
Added to library: Sat May 14 08:59:36 2011 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | P | L | G | S | I | G | E | S | E | V | R | A | L | Y | K | A | I | L | K | F | G | N | L | K | E | I | L | D | E | L | I | A | D | G | T | L | P | V | K | S | F | E | K | Y | G | E | T | Y | D | E | M | M | E | A | A | K | D | C | V | H | E | E | E | K | N | R | K | E | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | E | K | L | E | K | H | A | T | A | Y | R | A | K | L | K | S | G | E | I | K | A | E | N | Q | P | K | D | N | P | L | T | R | L | S | L | K | K | R | E | K | K | A | V | L | F | N | F | K | G | V | K | S | L | N | A | E | S | L | L | S | R | V | E | D | L | K | Y | L | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | T | T | S | S | S | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | N | L | I | N | S | N | Y | K | D | D | P | L | K | F | S | L | G | N | N | T | P | K | P | V | Q | N | W | S | S | N | W | T | K | E | E | D | E | K | L | L | I | G | V | F | K | Y | G | Y | G | S | W | T | Q | I | R | D | D | P | F | L | G | I | T | D | K | I | F | L | K | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | G | G | G | T | T | T | T | S | S | S | T | T | T | T | T | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||
Sequence | V | P | G | A | I | H | L | G | R | R | V | D | Y | L | L | S | F | L | R | G | G | L | N | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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