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| Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 | |||||||
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| Fold library id | PDB Header | Molecule | Title | 
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| c2x5yA_ | PDB header: immune system | Chain: A: PDB Molecule: zinc finger ccch-type antiviral protein 1; | PDBTitle: human zc3hav1 (artd13), c-terminal domain | 
| Added to library: Sat Aug 28 16:53:49 2010 | |
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| Sequence | K | K | Y | K | L | S | E | I | H | H | L | H | P | E | Y | V | R | V | S | E | H | F | K | A | S | M | K | N | F | K | I | E | K | I | K | K | I | E | N | S | E | L | L | D | K | F | T | W | K | K | S | Q | M | K | E | E | G | K | L | L | F | Y | A | T | S | R | A | Y | V | E | 
| Predicted secondary structure |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | ||||||||||||||||||||||
| SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Known secondary structure (DSSP) |  |  |  |  | T | T | S |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | T | T | T | T |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | T |  |  |  |  |  |  |  |  | G | G | G |  |  |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 | 
| Sequence | S | I | C | S | N | N | F | D | S | F | L | H | E | T | H | E | N | K | Y | G | K | G | I | Y | F | A | K | D | A | I | Y | S | H | K | N | C | P | Y | D | A | K | N | V | V | M | F | V | A | Q | V | L | V | G | K | F | I | E | G | N | I | T | Y | T | S | P | P | P | Q | F | D | 
| Predicted secondary structure |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Known secondary structure (DSSP) |  |  |  |  |  |  |  |  |  | S | S | S | S | S | S |  |  |  |  | S | S |  |  |  |  |  |  |  | S | G | G | G |  |  |  |  |  |  |  |  | S |  |  |  | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | 
| Sequence | S | C | V | D | T | R | S | N | P | S | V | F | V | I | F | Q | K | D | Q | V | Y | P | Q | Y | V | I | E | Y | T | E | D | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Predicted secondary structure |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Known secondary structure (DSSP) |  |  |  | S | S | S | S |  |  |  |  | G | G | G |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | 
| Download: | PDB structure | FASTA sequence | 
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