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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2wimA_ | PDB header: cell adhesion | Chain: A: PDB Molecule: neural cell adhesion molecule 2; | PDBTitle: crystal structure of ncam2 ig1-3 |
Added to library: Sat Aug 28 20:22:28 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | L | L | Q | V | T | I | S | L | S | K | V | E | L | S | V | G | E | S | K | F | F | T | C | T | A | I | G | E | P | E | S | I | D | W | Y | N | P | Q | G | E | K | I | I | S | T | Q | R | V | V | V | Q | K | E | G | V | R | S | R | L | T | I | Y | N | A | N | I | E | D | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S | B | T | T | B | B | T | T | T | T | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | I | Y | R | C | Q | A | T | D | A | K | G | Q | T | Q | E | A | T | V | V | L | E | I | Y | Q | K | L | T | F | R | E | V | V | S | P | Q | E | F | K | Q | G | E | D | A | E | V | V | C | R | V | S | S | S | P | A | P | A | V | S | W | L | Y | H | T | T | I | S | D | N | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | B | S | S | T | T | S | B | S | S | B | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | F | A | M | L | A | N | N | N | L | Q | I | L | N | I | N | K | S | D | E | G | I | Y | R | C | E | G | R | V | E | A | R | G | E | I | D | F | R | D | I | I | V | I | V | N | V | P | P | A | I | S | M | P | Q | K | S | F | N | A | T | A | E | R | G | E | E | M | T | F | S | C |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | G | G | G | T | T | T | T | B | B | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . |
Sequence | R | A | S | G | S | P | E | P | A | I | S | W | F | R | N | G | K | L | I | E | E | N | E | K | Y | I | L | K | G | S | N | T | E | L | T | V | R | N | I | I | N | S | D | G | G | P | Y | V | C | R | A | T | N | K | A | G | E | D | E | K | Q | A | F | L | Q | V | ||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | B | S | T | T | T | T | T | S | T | T | S | S | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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