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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2w2dD_ | PDB header: hydrolase | Chain: D: PDB Molecule: botulinum neurotoxin a heavy chain; | PDBTitle: crystal structure of a catalytically active, non-toxic2 endopeptidase derivative of clostridium botulinum toxin a |
Added to library: Sat Aug 28 22:11:17 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | L | N | L | Q | C | I | K | V | N | N | W | D | L | F | F | S | P | S | E | D | N | F | T | N | D | L | N | K | G | E | E | I | T | S | D | T | N | I | E | A | A | E | E | N | I | S | L | D | L | I | Q | Q | Y | Y | L | T | F | N | F | D | N | E | P | E | N | I | S | I | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | G | G | G | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | N | L | S | S | D | I | I | G | Q | L | E | L | M | P | N | I | E | R | F | P | N | G | K | K | Y | E | L | D | K | Y | T | M | F | H | Y | L | R | A | Q | E | F | E | H | R | I | A | L | T | N | S | V | N | E | A | L | P | S | R | V | Y | T | F | F | S | S | D | Y | V | K | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T | S | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | V | E | A | A | M | F | L | G | W | V | E | Q | L | V | Y | D | F | T | D | E | T | S | E | V | S | T | D | I | T | I | I | I | P | Y | I | G | P | A | L | N | I | G | N | M | L | K | D | D | F | V | G | A | L | I | F | S | G | A | V | I | L | L | E | F | I | P | E | I | A | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | S | S | B | B | T | T | T | S | T | G | G | G | G | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | P | V | L | G | T | F | A | L | V | S | Y | I | A | N | K | V | L | T | V | Q | T | I | D | N | A | L | S | K | R | N | E | K | W | D | E | V | Y | K | Y | I | V | T | N | W | L | A | K | V | N | T | Q | I | D | L | I | R | K | K | M | K | E | A | L | E | N | Q | A | E | A | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 350 |
Sequence | K | A | I | I | N | Y | Q | Y | N | Q | Y | T | E | E | E | K | N | N | F | N | I | D | D | L | S | S | K | L | N | E | S | I | N | K | A | M | I | N | I | N | K | F | L | N | Q | C | S | V | S | Y | L | M | N | S | M | I | P | Y | G | V | K | R | L | E | D | F | D | A | S | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 360 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 370 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 380 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 390 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 400 | . | . | . | . | . | . | . | ||
Sequence | K | D | A | L | L | K | Y | I | Y | D | N | R | G | T | L | I | G | Q | V | D | R | L | K | D | K | V | N | N | T | L | S | T | D | I | P | F | Q | L | S | K | Y | V | D | N | Q | R | L | L | S | T | F | T | E | Y | I | K | N | |||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | G | G | G | S | T | T | S | G | G | G | T | T | T |
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