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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2uxqB_ | PDB header: oxidoreductase | Chain: B: PDB Molecule: isocitrate dehydrogenase native; | PDBTitle: isocitrate dehydrogenase from the psychrophilic bacterium2 desulfotalea psychrophila: biochemical properties and3 crystal structure analysis |
Added to library: Tue Mar 16 11:58:55 2010 | |
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Sequence | M | K | I | Q | M | K | T | P | L | V | E | L | D | G | D | E | M | T | R | V | L | W | P | L | I | K | D | K | L | L | L | P | F | I | D | L | Q | T | E | Y | Y | D | L | G | I | E | E | R | D | R | T | N | D | Q | I | T | I | D | A | A | E | A | I | K | K | Y | G | V | G | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | T | T | T | T | B | S | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | N | A | T | I | T | P | N | Q | D | R | V | E | E | Y | G | L | K | E | Q | W | K | S | P | N | A | T | V | R | A | M | L | D | G | T | V | F | R | K | P | I | M | V | K | N | I | K | P | S | V | R | S | W | Q | K | P | I | V | V | G | R | H | A | Y | G | D | F | Y | K | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | T | T | B | S | S | T | T | S | S | G | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | E | I | F | A | E | A | G | G | K | L | E | I | V | V | T | D | K | N | G | K | E | T | R | Q | T | I | M | E | V | D | E | P | A | I | V | Q | G | I | H | N | T | V | A | S | I | G | H | F | A | R | A | C | F | E | Y | S | L | D | Q | K | I | D | C | W | F | A | T | K | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | T | I | S | K | Q | Y | D | Q | R | F | K | I | I | F | E | E | I | F | A | Q | E | Y | K | E | K | F | A | A | A | G | I | E | Y | F | Y | T | L | I | D | D | V | V | A | R | M | M | K | T | E | G | G | M | L | W | A | C | K | N | Y | D | G | D | V | M | S | D | M | V | A | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 350 |
Sequence | A | F | G | S | L | A | M | M | S | S | V | L | V | S | P | Y | G | Y | F | E | Y | E | A | A | H | G | T | V | Q | R | H | Y | Y | Q | H | L | K | G | E | R | T | S | T | N | P | V | A | L | I | Y | A | W | T | G | A | L | R | K | R | G | E | L | D | G | T | P | D | L | C | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 360 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 370 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 380 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 390 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 400 | . | |||||||
Sequence | F | C | D | S | L | E | A | I | T | I | E | C | I | E | S | G | Y | M | T | G | D | L | A | R | I | C | E | P | A | A | I | K | V | L | D | S | I | E | F | I | D | E | L | G | K | R | L | Q | Q | L | N | |||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | B | S | S | S |
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