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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2uv0G_ | PDB header: transcription | Chain: G: PDB Molecule: transcriptional activator protein lasr; | PDBTitle: structure of the p. aeruginosa lasr ligand-binding domain2 bound to its autoinducer |
Added to library: Tue Mar 16 13:30:01 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | L | V | D | G | F | L | E | L | E | R | S | S | G | K | L | E | W | S | A | I | L | Q | K | X | A | S | D | L | G | F | S | K | I | L | F | G | L | L | P | K | D | S | Q | D | Y | E | N | A | F | I | V | G | N | Y | P | A | A | W | R | E | H | Y | D | R | A | G | Y | A | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | G | G | G | S | S | T | T | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | D | P | T | V | S | H | C | T | Q | S | V | L | P | I | F | W | E | P | S | I | Y | Q | T | R | K | Q | H | E | F | F | E | E | A | S | A | A | G | L | V | Y | G | L | T | X | P | L | H | G | A | R | G | E | L | G | A | L | S | L | S | V | E | A | E | N | R | A | E | A | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | G | G | G | S | T | T | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | R | F | X | E | S | V | L | P | T | L | W | X | L | K | D | Y | A | L | Q | S | G | A | G | L | A | F | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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