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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2rgnB_ | PDB header: signaling protein complex | Chain: B: PDB Molecule: rhoa/rac/cdc42 exchange factor; | PDBTitle: crystal structure of p63rhogef complex with galpha-q and2 rhoa |
Added to library: Tue Mar 16 13:52:03 2010 | |
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Sequence | S | E | E | E | Q | K | K | K | A | L | E | R | S | M | Y | V | L | S | E | L | V | E | T | E | K | M | Y | V | D | D | L | G | Q | I | V | E | G | Y | M | A | T | M | A | A | Q | G | V | P | E | S | L | R | G | R | D | R | I | V | F | G | N | I | Q | Q | I | Y | E | W | H | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | S | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | Y | F | L | Q | E | L | Q | R | C | L | K | D | P | D | W | L | A | Q | L | F | I | K | H | E | R | R | L | H | M | Y | V | V | Y | C | Q | N | K | P | K | S | E | H | V | V | S | E | F | G | D | S | Y | F | E | E | L | R | Q | Q | L | G | H | R | L | Q | L | N | D | L | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | G | G | G | T | T | T | T | T | T | S | T | T | T | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | I | K | P | V | Q | R | I | M | K | Y | Q | L | L | L | K | D | F | L | K | Y | Y | N | R | A | G | M | D | T | A | D | L | E | Q | A | V | E | V | M | C | F | V | P | K | R | C | N | D | M | M | T | L | G | R | L | R | G | F | E | G | K | L | T | A | Q | G | K | L | L | G | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | S | S | S | S | G | G | G | B | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | D | T | F | W | V | T | E | P | S | R | G | R | E | R | R | V | F | L | F | E | Q | I | I | I | F | S | E | A | L | G | P | G | Y | V | Y | K | N | S | I | K | V | S | C | L | G | L | E | G | N | L | Q | G | D | P | C | R | F | A | L | T | S | R | G | P | E | G | G | I | Q | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | G | G | G | S | G | G | G | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||
Sequence | Y | V | L | Q | A | A | D | P | A | I | S | Q | A | W | I | K | H | V | A | Q | I | L | E | S | Q | R | D | F | L | N | A | L | Q | S | P | I | E | Y | Q | R | R | E | S | Q | T | N | S | |||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | S |
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