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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2r83B_ | PDB header: endocytosis, exocytosis | Chain: B: PDB Molecule: synaptotagmin-1; | PDBTitle: crystal structure analysis of human synaptotagmin 1 c2a-c2b |
Added to library: Tue Mar 16 12:56:36 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | K | L | G | K | L | Q | Y | S | L | D | Y | D | F | Q | N | N | Q | L | L | V | G | I | I | Q | A | A | E | L | P | A | L | D | M | G | G | T | S | D | P | Y | V | K | V | F | L | L | P | D | K | K | K | K | F | E | T | K | V | H | R | K | T | L | N | P | V | F | N | E | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | S | T | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | F | T | F | K | V | P | Y | S | E | L | A | G | K | T | L | V | M | A | V | Y | D | F | D | R | F | S | K | H | D | I | I | G | E | F | K | V | P | M | N | T | V | D | F | G | H | V | T | E | E | W | R | D | L | Q | S | A | E | K | E | E | Q | E | K | L | G | D | I | C | F | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | S | S | S | G | G | G | S | S | B | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | R | Y | V | P | T | A | G | K | L | T | V | V | I | L | E | A | K | N | L | K | K | M | D | V | G | G | L | S | D | P | Y | V | K | I | H | L | M | Q | N | G | K | R | L | K | K | K | K | T | T | I | K | K | N | T | L | N | P | Y | Y | N | E | S | F | S | F | E | V | P | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | T | T | S | T | T | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | E | Q | I | Q | K | V | Q | V | V | V | T | V | L | D | Y | D | K | I | G | K | N | D | A | I | G | K | V | F | V | G | Y | N | S | T | G | A | E | L | R | H | W | S | D | M | L | A | N | P | R | R | P | I | A | Q | W | H | T | L | Q | V | E | E | E | V | D | A | M | L | A | |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | S | S | S | T | T | S | T | T | S | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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