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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2r17C_ | PDB header: protein transport | Chain: C: PDB Molecule: vacuolar protein sorting-associated protein 35; | PDBTitle: functional architecture of the retromer cargo-recognition2 complex |
Added to library: Tue Mar 16 11:56:29 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | D | F | A | D | E | Q | S | L | V | G | R | F | I | H | L | L | R | S | E | D | P | D | Q | Q | Y | L | I | L | N | T | A | R | K | H | F | G | A | G | G | N | Q | R | I | R | F | T | L | P | P | L | V | F | A | A | Y | Q | L | A | F | R | Y | K | E | N | S | K | V | D | D | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | S | T | T | S | S | S | T | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | W | E | K | K | C | Q | K | I | F | S | F | A | H | Q | T | I | S | A | L | I | K | A | E | L | A | E | L | P | L | R | L | F | L | Q | G | A | L | A | A | G | E | I | G | F | E | N | H | E | T | V | A | Y | E | F | X | S | Q | A | F | S | L | Y | E | D | E | I | S | D | S | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | Q | L | A | A | I | T | L | I | I | G | T | F | E | R | X | K | C | F | S | E | E | N | H | E | P | L | R | T | Q | C | A | L | A | A | S | K | L | L | K | K | P | D | Q | G | R | A | V | S | T | C | A | H | L | F | W | S | G | R | N | T | D | K | N | G | E | E | L | H | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | T | T | B | T | T | T | T | T | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | G | K | R | V | X | E | C | L | K | K | A | L | K | I | A | N | Q | C | X | D | P | S | L | Q | V | Q | L | F | I | E | I | L | N | R | Y | I | Y | F | Y | E | K | E | N | D | A | V | T | I | Q | V | L | N | Q | L | I | Q | K | I | R | E | D | L | P | N | L | E | S | S | E | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T | S | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | T | E | Q | I | N | K | H | F | H | N | T | L | E | H | L | R | L | R | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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