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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2r15A_ | PDB header: contractile protein | Chain: A: PDB Molecule: myomesin-1; | PDBTitle: crystal structure of the myomesin domains 12 and 13 |
Added to library: Tue Mar 16 12:46:06 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | L | S | A | T | D | L | K | I | Q | S | T | A | E | G | I | Q | L | Y | S | F | V | T | Y | Y | V | E | D | L | K | V | N | W | S | H | N | G | S | A | I | R | Y | S | D | R | V | K | T | G | V | T | G | E | Q | I | W | L | Q | I | N | E | P | T | P | N | D | K | G | K | Y | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | B | S | S | S | S | T | T | S | S | T | T | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | M | E | L | F | D | G | K | T | G | H | Q | K | T | V | D | L | S | G | Q | A | Y | D | E | A | Y | A | E | F | Q | R | L | K | Q | A | A | I | A | E | K | N | R | A | R | V | L | G | G | L | P | D | V | V | T | I | Q | E | G | K | A | L | N | L | T | C | N | V | W | G | D | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | P | P | E | V | S | W | L | K | N | E | K | A | L | A | Q | T | D | H | C | N | L | K | F | E | A | G | R | T | A | Y | F | T | I | N | G | V | S | T | A | D | S | G | K | Y | G | L | V | V | K | N | K | Y | G | S | E | T | S | D | F | T | V | S | V | F | I | P | E | |||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | T | S | S | G | G | G | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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