|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c2qv2A_ | PDB header: hydrolase | Chain: A: PDB Molecule: inositol polyphosphate 5-phosphatase ocrl-1; | PDBTitle: a role of the lowe syndrome protein ocrl in early steps of2 the endocytic pathway |
Added to library: Tue Mar 16 12:45:10 2010 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | S | R | R | E | F | V | F | E | N | V | K | F | R | Q | L | Q | K | E | K | F | Q | I | S | N | I | P | K | L | N | D | S | Q | Y | C | K | P | W | L | R | A | E | P | F | E | G | Y | L | E | P | N | E | T | V | D | I | S | L | D | V | Y | V | S | K | D | S | V | T | I | L | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | S | T | T | S | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | G | E | D | K | I | E | D | I | L | V | L | F | L | T | I | S | G | N | Y | L | P | S | C | F | G | T | S | L | E | A | L | C | R | M | K | R | P | I | R | E | V | P | V | T | K | L | I | D | L | E | E | D | S | F | L | E | K | E | K | S | L | L | Q | M | E | R | P | L | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T | T | S | T | T | S | S | T | T | T | T | T | S | S | T | T | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | V | P | K | E | I | W | L | L | V | D | H | L | F | K | Y | A | C | H | Q | E | D | L | F | Q | T | P | G | M | Q | E | E | L | Q | Q | I | I | D | C | L | D | T | S | I | P | E | T | I | P | G | S | N | H | S | V | A | E | A | L | L | I | F | L | E | A | L | P | E | P | V | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | C | Y | E | L | Y | Q | R | C | L | D | S | A | Y | D | P | R | I | C | R | Q | V | I | S | Q | L | P | R | C | H | R | N | V | F | R | Y | L | M | A | F | L | R | E | L | L | K | F | S | E | Y | N | S | V | N | A | N | M | I | A | T | L | F | T | S | L | L | L | R | P | P | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | T | S | T | T | B | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | N | L | M | A | R | Q | T | P | S | D | R | Q | R | A | I | Q | F | L | L | G | F | L | L | G | S | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|