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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2qufB_ | PDB header: transcription | Chain: B: PDB Molecule: transcription factor pf0095; | PDBTitle: crystal structure of transcription factor axxa-pf0095 from2 pyrococcus furiosus |
Added to library: Tue Mar 16 14:07:35 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | P | D | L | F | Y | I | L | G | N | K | V | R | R | D | L | L | S | H | L | T | A | M | E | A | Y | F | S | L | L | S | S | K | V | S | V | S | S | T | A | V | A | K | H | L | K | I | M | E | R | E | G | V | L | Q | S | Y | Y | K | I | S | I | A | K | S | Y | V | F | T | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | P | E | M | F | W | Y | K | G | L | D | L | G | D | A | E | L | R | D | F | E | I | S | L | S | G | L | D | T | E | P | S | T | L | K | E | M | I | T | D | F | I | K | A | N | K | E | L | E | K | V | L | E | A | F | K | T | I | E | S | Y | R | S | S | L | M | R | K | I | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | E | A | Y | L | K | E | I | G | D | M | T | Q | L | A | I | L | H | Y | L | L | L | N | G | R | A | T | V | E | E | L | S | D | R | L | N | L | K | E | R | E | V | R | E | K | I | S | E | M | A | R | F | V | P | V | K | I | I | N | D | N | T | V | V | L | D | E | D | Q | I | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | T | T | T | S | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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