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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2qqhA_ | PDB header: immune system, membrane protein | Chain: A: PDB Molecule: complement component c8 alpha chain; | PDBTitle: structure of c8a-macpf reveals mechanism of membrane attack2 in complement immune defense |
Added to library: Tue Mar 16 12:37:03 2010 | |
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Sequence | S | V | R | A | I | D | E | D | C | S | Q | Y | E | P | I | P | G | S | Q | K | A | A | L | G | Y | N | I | L | T | Q | E | D | A | Q | S | V | Y | D | A | S | Y | Y | G | G | Q | C | E | T | V | Y | N | G | E | W | R | E | L | D | D | E | K | Y | F | R | K | P | Y | N | F | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | S | S | S | S | S | B | T | T | T | T | T | T | B | T | T | T | T | S | B | T | T | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | Y | H | F | E | A | L | A | D | T | G | I | S | S | E | F | Y | D | N | A | N | D | L | L | S | K | V | K | K | D | K | S | D | S | F | G | V | T | I | G | I | G | P | A | G | S | P | L | L | V | G | V | G | V | S | H | S | Q | D | T | S | F | L | N | E | L | N | K | Y | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | G | G | G | S | S | S | S | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | E | K | K | F | I | F | T | R | I | F | T | K | V | Q | T | A | H | F | K | M | R | K | D | D | I | M | L | D | E | G | M | L | Q | S | L | M | E | L | P | D | Q | Y | N | Y | G | M | Y | A | K | F | I | N | D | Y | G | T | H | Y | I | T | S | G | S | M | G | G | I | Y | E | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | B | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | I | L | V | I | D | K | A | K | M | E | S | L | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | R | K | A | M | A | V | E | D | I | I | S | R | V | R | G | G | S | S | G | Y | R | S | W | G | R | S | L | K | Y | N | P | V | V | I | D | F | E | M | Q | P | I | H | E | V | L | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | G | G | G | S | G | G | G | G | G | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | H | T | S | L | G | P | L | E | A | K | R | Q | N | L | R | R | A | L | D | Q | Y | L | M | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | G | G | G |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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