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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2qq8A_ | PDB header: hydrolase activator | Chain: A: PDB Molecule: tbc1 domain family member 14; | PDBTitle: crystal structure of the putative rabgap domain of human2 tbc1 domain family member 14 |
Added to library: Tue Mar 16 12:10:38 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | Y | F | Q | G | N | A | V | L | T | W | N | N | E | I | L | P | N | W | E | W | C | S | R | K | V | R | D | L | W | W | Q | G | I | P | P | S | V | R | G | K | V | W | S | L | A | I | G | N | E | L | N | I | T | H | E | L | F | D | I | C | L | A | R | A | K | E | R | W | E | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | G | G | G | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | L | E | L | I | K | L | D | I | S | R | T | F | P | N | L | C | I | F | Q | Q | G | G | P | Y | H | D | M | L | H | S | I | L | G | A | Y | T | C | Y | R | P | D | V | G | Y | V | Q | G | M | S | F | I | A | A | V | L | I | L | N | L | D | T | A | D | A | F | I | A | F | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | G | G | G | S | S | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | N | L | L | N | K | P | C | Q | M | A | F | F | R | V | D | H | G | L | M | L | T | Y | F | A | A | F | E | V | F | F | E | E | N | L | P | K | L | F | A | H | F | K | K | N | N | L | T | P | D | I | Y | L | I | D | W | I | F | T | L | Y | S | K | S | L | P | L | D | L | A | C |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | T | T | G | G | G | T | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | R | I | W | D | V | F | C | R | D | G | E | E | F | L | F | R | T | A | L | G | I | L | K | L | F | E | D | I | L | T | K | M | D | F | I | H | M | A | Q | F | L | T | R | L | P | E | D | L | P | A | E | E | L | F | A | S | I | A | T | I | Q | M | Q | S | R | N | K | K | W | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | Q | V | L | T | A | L | Q | K | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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