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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2qgiA_ | PDB header: transferase | Chain: A: PDB Molecule: atp synthase subunits region orf 6; | PDBTitle: the udp complex structure of the sixth gene product of the2 f1-atpase operon of rhodobacter blasticus |
Added to library: Tue Mar 16 13:24:37 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | K | P | V | P | T | Y | V | Q | D | K | D | E | S | T | L | M | F | S | V | C | S | L | V | R | D | Q | A | K | Y | D | R | L | L | E | S | F | E | R | F | G | F | T | P | D | K | A | E | F | L | A | A | D | N | R | E | G | N | Q | F | H | G | F | S | W | H | K | Q | M | L | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | T | T | T | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | R | C | K | G | R | Y | V | I | F | C | H | E | D | V | E | L | V | D | R | G | Y | D | D | L | V | A | A | I | E | A | L | E | E | A | D | P | K | W | L | V | A | G | V | A | G | S | P | W | R | P | L | N | H | S | V | T | A | Q | A | L | H | I | S | D | V | F | G | N | D | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | S | S | T | T | S | S | T | T | S | S | S | S | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | R | R | G | N | V | P | C | R | V | E | S | L | D | E | C | F | L | L | M | R | R | L | K | P | V | L | N | S | Y | D | M | Q | G | F | H | Y | Y | G | A | D | L | C | L | Q | A | E | F | L | G | G | R | A | Y | A | I | D | F | H | L | H | H | Y | G | R | A | I | A | D | E | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | T | T | B | S | S | S | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||
Sequence | F | H | R | L | R | Q | E | M | A | Q | K | Y | R | R | W | F | P | G | R | I | L | H | C | V | T | G | R | V | A | L | G | G | G | W | Y | E | A | R | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | T | T | G | G | G | G |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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