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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2qepA_ | PDB header: hydrolase | Chain: A: PDB Molecule: receptor-type tyrosine-protein phosphatase n2; | PDBTitle: crystal structure of the d1 domain of ptprn2 (ia2beta) |
Added to library: Tue Mar 16 12:40:16 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | D | I | S | T | G | H | M | I | L | S | Y | M | E | D | H | L | K | N | K | N | R | L | E | K | E | W | E | A | L | C | A | Y | Q | A | E | P | N | S | S | F | V | A | Q | R | E | E | N | V | P | K | N | R | S | L | A | V | L | T | Y | D | H | S | R | V | L | L | K | A | E | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | T | T | S | T | T | T | G | G | G | S | T | T | G | G | G | B | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | H | S | H | S | D | Y | I | N | A | S | P | I | M | D | H | D | P | R | N | P | A | Y | I | A | T | Q | G | P | L | P | A | T | V | A | D | F | W | Q | M | V | W | E | S | G | C | V | V | I | V | M | L | T | P | L | A | E | N | G | V | R | Q | C | Y | H | Y | W | P | D | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | B | S | S | S | S | S | S | S | G | G | G | T | T | S | S | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | G | S | N | L | Y | H | I | Y | E | V | N | L | V | S | E | H | I | W | C | E | D | F | L | V | R | S | F | Y | L | K | N | L | Q | T | N | E | T | R | T | V | T | Q | F | H | F | L | S | W | Y | D | R | G | V | P | S | S | S | R | S | L | L | D | F | R | R | K | V | N | K | C |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T | T | T | T | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | Y | R | G | R | S | C | P | I | I | V | H | C | S | D | G | A | G | R | S | G | T | Y | V | L | I | D | M | V | L | N | K | M | A | K | G | K | E | I | D | I | A | A | T | L | E | H | L | R | D | Q | R | P | G | M | V | Q | T | K | E | Q | F | E | F | A | L | T | A | V | A | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | E | V | N | A | I | L | A | H | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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