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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2qcjB_ | PDB header: hydrolase | Chain: B: PDB Molecule: tyrosine-protein phosphatase non-receptor type | PDBTitle: native structure of lyp |
Added to library: Tue Mar 16 14:12:17 2010 | |
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Sequence | L | Q | K | F | L | D | E | A | Q | S | K | K | I | T | K | E | E | F | A | N | E | F | L | K | L | K | R | Q | S | T | K | Y | K | A | D | K | T | Y | P | T | T | V | A | E | K | P | K | N | I | K | K | N | R | Y | K | D | I | L | P | Y | D | Y | S | R | V | E | L | S | L | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | G | G | G | G | G | G | S | S | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | S | D | E | D | S | S | Y | I | N | A | N | F | I | K | G | V | Y | G | P | K | A | Y | I | A | T | Q | G | P | L | S | T | T | L | L | D | F | W | R | M | I | W | E | Y | S | V | L | I | I | V | M | A | C | M | E | Y | E | M | G | K | K | K | C | E | R | Y | W | A | E | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | G | E | M | Q | L | E | F | G | P | F | S | V | S | C | E | A | E | K | R | K | S | D | Y | I | I | R | T | L | K | V | K | F | N | S | E | T | R | T | I | Y | Q | F | H | Y | K | N | W | P | D | H | D | V | P | S | S | I | D | P | I | L | E | L | I | W | D | V | R | C | Y | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | V | P | I | C | I | H | C | S | A | G | C | G | R | T | G | V | I | C | A | I | D | Y | T | W | M | L | L | K | D | G | I | I | P | E | N | F | S | V | F | S | L | I | R | E | M | R | T | Q | R | P | S | L | V | Q | T | Q | E | Q | Y | E | L | V | Y | N | A | V | L | E | L | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | S | T | T | T | T | T | T | S | T | T | T | T | T |
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