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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2qc5A_ | PDB header: lyase | Chain: A: PDB Molecule: streptogramin b lactonase; | PDBTitle: streptogramin b lyase structure |
Added to library: Tue Mar 16 13:11:35 2010 | |
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Sequence | S | E | A | W | M | N | F | Y | L | E | E | F | N | L | S | I | P | D | S | G | P | Y | G | I | T | S | S | E | D | G | K | V | W | F | T | Q | H | K | A | N | K | I | S | S | L | D | Q | S | G | R | I | K | E | F | E | V | P | T | P | D | A | K | V | M | C | L | I | V | S | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | S | S | T | T | T | T | S | T | T | T | T | T | T | S | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | G | D | I | W | F | T | E | N | G | A | N | K | I | G | K | L | S | K | K | G | G | F | T | E | Y | P | L | P | Q | P | D | S | G | P | Y | G | I | T | E | G | L | N | G | D | I | W | F | T | Q | L | N | G | D | R | I | G | K | L | T | A | D | G | T | I | Y | E | Y | D | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | T | T | T | T | S | S | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | P | N | K | G | S | Y | P | A | F | I | T | L | G | S | D | N | A | L | W | F | T | E | N | Q | N | N | S | I | G | R | I | T | N | T | G | K | L | E | E | Y | P | L | P | T | N | A | A | A | P | V | G | I | T | S | G | N | D | G | A | L | W | F | V | E | I | M | G | N | K | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | T | T | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | G | R | I | T | T | T | G | E | I | S | E | Y | D | I | P | T | P | N | A | R | P | H | A | I | T | A | G | K | N | S | E | I | W | F | T | E | W | G | A | N | Q | I | G | R | I | T | N | D | N | T | I | Q | E | Y | Q | L | Q | T | E | N | A | E | P | H | G | I | T | F | G | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | D | G | S | V | W | F | A | L | K | C | K | I | G | K | L | N | L | N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S |
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