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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2q8aA_ | PDB header: immune system | Chain: A: PDB Molecule: apical membrane antigen 1; | PDBTitle: structure of the malaria antigen ama1 in complex with a2 growth-inhibitory antibody |
Added to library: Tue Mar 16 13:10:10 2010 | |
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Sequence | G | N | P | W | T | E | Y | M | A | K | Y | D | I | E | E | V | H | G | S | G | I | R | V | D | L | G | E | D | A | E | V | A | G | T | Q | Y | R | L | P | S | G | K | C | P | V | F | G | K | G | I | I | I | E | N | S | N | T | T | F | L | T | P | V | A | T | G | N | Q | Y | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | T | S | S | S | B | T | T | S | S | T | T | T | S | S | T | T | S | B | T | T | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | D | G | G | F | A | F | P | P | T | E | P | L | M | S | P | M | T | L | D | E | M | R | H | F | Y | K | D | N | K | Y | V | K | N | L | D | E | L | T | L | C | S | R | H | A | G | N | M | I | P | D | N | D | K | N | S | N | Y | K | Y | P | A | V | Y | D | D | K | D | K | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | S | B | S | S | S | S | T | T | T | T | S | T | T | S | G | G | G | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | C | H | I | L | Y | I | A | A | Q | E | N | N | G | P | R | Y | C | N | K | D | E | S | K | R | N | S | M | F | C | F | R | P | A | K | D | I | S | F | Q | N | Y | T | Y | L | S | K | N | V | V | D | N | W | E | K | V | C | P | R | K | N | L | Q | N | A | K | F | G | L | W | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | B | T | T | T | S | S | S | S | S | G | G | G | T | T | T | T | T | T | S | S | B | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | D | G | N | C | E | D | I | P | H | V | N | E | F | P | A | I | D | L | F | E | C | N | K | L | V | F | E | L | S | A | S | D | Q | P | E | Q | H | L | T | D | Y | E | K | I | K | E | G | F | K | N | K | N | A | S | M | I | K | Y | K | S | H | G | K | G | Y | N | W | G | N | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | B | S | T | T | B | S | S | S | S | B | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||
Sequence | N | T | E | T | Q | K | C | E | I | F | N | V | K | P | T | C | L | I | N | N | S | S | Y | I | A | T | T | A | L | S | H | P | I | E | V | E | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | T | T | S | S | S | S | S | B |
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