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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2q4uA_ | PDB header: structural genomics, unknown function | Chain: A: PDB Molecule: protein zgc:100843; | PDBTitle: ensemble refinement of the crystal structure of an ef-hand2 protein from danio rerio dr.36843 |
Added to library: Tue Mar 16 11:57:42 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | A | F | A | N | L | D | A | A | G | F | L | Q | I | W | Q | H | F | D | A | D | D | N | G | Y | I | E | G | K | E | L | D | D | F | F | R | H | X | L | K | K | L | Q | P | K | D | K | I | T | D | E | R | V | Q | Q | I | K | K | S | F | X | S | A | Y | D | A | T | F | D | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | G | G | G | S | T | T | T | S | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | R | L | Q | I | E | E | L | A | N | X | I | L | P | Q | E | E | N | F | L | L | I | F | R | R | E | A | P | L | D | N | S | V | E | F | X | K | I | W | R | K | Y | D | A | D | S | S | G | Y | I | S | A | A | E | L | K | N | F | L | K | D | L | F | L | Q | H | K | K | K | I | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | P | N | K | L | D | E | Y | T | D | A | X | X | K | I | F | D | K | N | K | D | G | R | L | D | L | N | D | L | A | R | I | L | A | L | Q | E | N | F | L | L | Q | F | K | X | D | A | S | S | Q | V | E | R | K | R | D | F | E | K | I | F | A | H | Y | D | V | S | R | T | G | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | G | G | G | S | T | T | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 |
Sequence | L | E | G | P | E | V | D | G | F | V | K | D | X | X | E | L | V | R | P | S | I | S | G | G | D | L | D | K | F | R | E | C | L | L | T | H | C | D | X | N | K | D | G | K | I | Q | K | S | E | L | A | L | C | L | G | L | K | H | K | P | ||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | S | T | T | T | S | S | S | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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