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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2q3xA_ | PDB header: transport protein | Chain: A: PDB Molecule: regulating synaptic membrane exocytosis protein | PDBTitle: the rim1alpha c2b domain |
Added to library: Tue Mar 16 13:36:52 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | P | G | P | A | Q | L | V | G | R | Q | A | X | G | D | I | Q | I | G | X | E | D | K | K | G | Q | L | E | V | E | V | I | R | A | R | S | L | T | Q | K | P | S | T | P | A | P | Y | V | K | V | Y | L | L | E | N | G | A | C | I | A | K | K | K | T | R | I | A | R | K | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | D | P | L | Y | Q | Q | S | L | V | F | D | E | S | P | Q | G | K | V | L | Q | V | I | V | W | G | D | Y | G | R | X | D | H | K | C | F | X | G | V | A | Q | I | L | L | E | E | L | D | L | S | S | X | V | I | G | W | Y | K | L | F | P | P | S | S | L | V | D | P | T | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | S | T | T | S | S | G | G | G | S | T | T | S | B | G | G | G | G | S | S |   | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | A | P | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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