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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2q2gA_ | PDB header: chaperone | Chain: A: PDB Molecule: heat shock 40 kda protein, putative (fragment); | PDBTitle: crystal structure of dimerization domain of hsp40 from2 cryptosporidium parvum, cgd2_1800 |
Added to library: Tue Mar 16 14:40:58 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | R | S | H | E | V | P | L | L | V | T | L | E | E | L | Y | L | G | K | R | K | K | I | K | V | T | R | K | R | F | I | E | H | K | V | R | N | E | E | N | I | V | E | V | E | I | K | P | G | W | K | D | G | T | K | L | T | Y | S | G | E | G | D | Q | E | S | P | G | T | S | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | D | L | V | L | I | I | Q | T | K | T | H | P | R | F | T | R | D | D | C | H | L | I | X | K | V | T | I | P | L | V | R | A | L | T | G | F | T | C | P | V | T | T | L | D | N | R | N | L | Q | I | P | I | K | E | I | V | N | P | K | T | R | K | I | V | P | N | E | G | X |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | S | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||
Sequence | P | I | K | N | Q | P | G | Q | K | G | D | L | I | L | E | F | D | I | C | F | P | K | S | L | T | P | E | Q | K | K | L | I | K | E | A | L | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | S | T | T | B | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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