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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2px2B_ | PDB header: transferase | Chain: B: PDB Molecule: genome polyprotein [contains: capsid protein c | PDBTitle: crystal structure of the murray valley encephalitis virus2 ns5 2'-o methyltransferase domain in complex with sah3 (monoclinic form 1) |
Added to library: Tue Mar 16 12:42:12 2010 | |
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Sequence | G | R | T | L | G | E | Q | W | K | E | K | L | N | A | M | G | K | E | E | F | F | S | Y | R | K | E | A | I | L | E | V | D | R | T | E | A | H | P | V | S | R | G | T | A | K | L | R | W | L | V | E | R | R | F | V | Q | P | I | G | K | V | V | D | L | G | C | G | R | G | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | S | S | S | T | T | S | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | W | S | Y | Y | A | A | T | M | K | N | V | Q | E | V | R | G | Y | T | K | G | G | P | G | H | E | E | P | M | L | M | Q | S | Y | G | W | N | I | V | T | M | K | S | G | V | D | V | F | Y | K | P | S | E | I | S | D | T | L | L | C | D | I | G | E | S | S | P | S | A | E | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | T | T | S | S | T | T | G | G | G | S | G | G | G | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | E | E | Q | R | T | L | R | I | L | E | M | V | S | D | W | L | S | R | G | P | K | E | F | C | I | K | I | L | C | P | Y | M | P | K | V | I | E | K | L | E | S | L | Q | R | R | F | G | G | G | L | V | R | V | P | L | S | R | N | S | N | H | E | M | Y | W | V | S | G | A | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | S | T | T | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | ||||||||||||||
Sequence | G | N | I | V | H | A | V | N | M | T | S | Q | V | L | I | G | R | M | D | K | K | I | W | K | G | P | K | Y | E | E | D | V | N | L | G | S | G | T | R | A | V | |||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | S | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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