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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2pv0A_ | PDB header: transferase regulator | Chain: A: PDB Molecule: dna (cytosine-5)-methyltransferase 3-like; | PDBTitle: dna methyltransferase 3 like protein (dnmt3l) |
Added to library: Tue Mar 16 13:05:50 2010 | |
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Sequence | G | R | D | L | I | A | Y | E | V | K | A | N | Q | R | N | I | E | D | I | C | I | C | C | G | S | L | Q | V | H | T | Q | H | P | L | F | E | G | G | I | C | A | P | C | K | D | K | F | L | D | A | L | F | L | Y | D | D | D | G | Y | Q | S | Y | C | S | I | C | C | S | G | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | G | G | G | S | B | T | T | T | S | S | S | B | S | S | T | T | S | S | B | T | T | S | S | B | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | L | L | I | C | G | N | P | D | C | T | R | C | Y | C | F | E | C | V | D | S | L | V | G | P | G | T | S | G | K | V | H | A | M | S | N | W | V | C | Y | L | C | L | P | S | S | R | S | G | L | L | Q | R | R | R | K | W | R | S | Q | L | K | A | F | Y | D | R | E | S | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | T | T | S | S | T | T | T | S | S | S | T | T | B | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | N | P | L | E | M | F | E | T | V | P | V | W | R | R | Q | P | V | R | V | L | S | L | F | E | D | I | K | K | E | L | T | S | L | G | F | L | E | S | G | S | D | P | G | Q | L | K | H | V | V | D | V | T | D | T | V | R | K | D | V | E | E | W | G | P | F | D | L | V | Y | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | S | S | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | A | T | P | P | L | G | H | T | C | D | R | P | P | S | W | Y | L | F | Q | F | H | R | L | L | Q | Y | A | R | P | K | P | G | S | P | G | P | F | F | W | M | F | V | D | N | L | V | L | N | K | E | D | L | D | V | A | S | R | F | L | E | M | E | P | V | T | I | P | D | V | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | G | G | S | L | Q | N | A | V | R | V | W | S | N | I | P | A | I | R | S | R | H | W | A | L | V | S | E | E | E | L | S | L | L | A | Q | N | K | Q | S | S | K | L | A | A | K | W | P | T | K | L | V | K | N | C | F | L | P | L | R | E | Y | F | K | Y | F | S | T | |||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S | G | G | G | G | G | G | G | G | G | T | S |
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