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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2pf6A_ | PDB header: cell adhesion | Chain: A: PDB Molecule: lutheran blood group glycoprotein; | PDBTitle: lutheran glycoprotein, n-terminal domains 1 and 2 |
Added to library: Tue Mar 16 13:35:55 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | V | R | L | S | V | P | P | L | V | E | V | M | R | G | K | S | V | I | L | D | C | T | P | T | G | T | H | D | H | Y | M | L | E | W | F | L | T | D | R | S | G | A | R | P | R | L | A | S | A | E | M | Q | G | S | E | L | Q | V | T | M | H | D | T | R | G | R | S | P | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | T | T | S | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Y | Q | L | D | S | Q | G | R | L | V | L | A | E | A | Q | V | G | D | E | R | D | Y | V | C | V | V | R | A | G | A | A | G | T | A | E | A | T | A | R | L | N | V | F | A | K | P | E | A | T | E | V | S | P | N | K | G | T | L | S | V | M | E | D | S | A | Q | E | I | A | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | G | G | G | G | G | G | B | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | C | N | S | R | N | G | N | P | A | P | K | I | T | W | Y | R | N | G | Q | R | L | E | V | P | V | E | M | N | P | E | G | Y | M | T | S | R | T | V | R | E | A | S | G | L | L | S | L | T | S | T | L | Y | L | R | L | R | K | D | D | R | D | A | S | F | H | C | A | A | H | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | T | T | S | S | S | S | T | T | S | G | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | S | L | P | E | G | R | H | G | R | L | D | S | P | T | F | H | L | T | L | H | Y | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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