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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2o3oD_ | PDB header: signaling protein | Chain: D: PDB Molecule: yyci protein; | PDBTitle: crystal structure of the sensor histidine kinase regulator2 yyci from bacillus subtitlis |
Added to library: Tue Mar 16 12:04:58 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | K | E | Y | E | V | I | K | N | D | V | E | H | D | X | K | A | D | H | I | T | Y | E | G | L | N | K | E | A | T | E | G | Y | R | I | T | A | N | Q | K | S | F | S | K | E | E | I | E | A | L | K | D | Q | K | P | L | X | D | X | P | S | D | D | H | K | V | T | S | L | K | X |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | S | S | B | T | S | T | T | S | S | S | B | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | F | A | N | P | I | A | L | S | K | K | D | I | E | D | D | A | Q | A | L | V | S | S | K | I | Q | D | G | E | K | Y | K | L | W | K | V | D | K | S | K | K | E | I | I | F | F | Q | T | Y | E | G | H | Y | I | Y | Q | K | T | D | N | P | S | N | X | I | G | Q | V | V | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | T | T | G | G | G | T | T | T | T | T | T | B | S | G | G | G | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | H | L | N | G | K | N | E | V | V | S | Y | D | Q | T | T | L | E | T | F | K | Q | I | Q | K | E | S | L | I | T | E | X | D | A | V | E | L | L | Y | Y | Q | N | Q | L | K | E | Y | S | T | V | K | S | C | K | F | G | Y | V | A | Q | Y | P | L | T | S | T | Q | V | L | A | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | B | T | T | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | |||||||||||||||||||||||||||
Sequence | V | W | R | I | T | V | E | Y | E | K | K | T | V | Q | E | Y | F | T | V | N | A | L | E | S | T | I | L | D | T | D | Q | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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