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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2mtdA_ | PDB header: protein binding | Chain: A: PDB Molecule: decorin binding protein a; | PDBTitle: strcucture of decorin binding protein a from strain pbr of borrelia2 garinii |
Added to library: Sat Mar 28 08:13:41 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | L | T | G | E | T | K | I | R | L | E | S | S | A | Q | E | I | K | D | E | I | N | K | I | K | A | N | A | K | K | E | G | V | K | F | E | A | F | T | N | T | Q | T | G | S | K | I | S | E | K | P | E | F | I | L | K | A | K | I | K | A | I | Q | V | A | E | R | F | V | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | S | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | I | K | E | E | A | E | K | L | K | K | S | G | S | S | G | A | F | S | A | M | Y | D | L | M | I | D | V | S | K | P | L | E | E | I | G | I | Q | K | M | T | G | T | V | K | E | A | A | Q | K | T | P | A | T | T | A | D | G | I | I | A | I | A | Q | A | M | E | D | K | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | N | N | V | N | K | K | Q | H | D | A | L | K | N | L | K | E | K | A | K | T | A | T | T | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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