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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2mlhA_ | PDB header: membrane protein | Chain: A: PDB Molecule: opacity protein opa60; | PDBTitle: nmr solution structure of opa60 from n. gonorrhoeae in fc-12 micelles |
Added to library: Sat Jun 28 08:14:45 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | S | E | D | G | G | R | G | P | Y | V | Q | A | D | L | A | Y | A | Y | E | H | I | T | H | D | Y | P | E | P | T | A | P | N | K | N | K | I | S | T | V | S | D | Y | F | R | N | I | R | T | R | S | V | H | P | R | V | S | V | G | Y | D | F | G | G | W | R | I | A | A | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Y | A | R | Y | R | K | W | N | N | N | K | Y | S | V | N | I | E | N | V | R | I | R | K | E | N | G | I | R | I | D | R | K | T | E | N | Q | E | N | G | T | F | H | A | V | S | S | L | G | L | S | A | I | Y | D | F | Q | I | N | D | K | F | K | P | Y | I | G | A | R | V | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | S | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Y | G | H | V | R | H | S | I | D | S | T | K | K | T | I | E | V | T | T | V | P | S | N | A | P | N | G | A | V | T | T | Y | N | T | D | P | K | T | Q | N | D | Y | Q | S | N | S | I | R | R | V | G | L | G | V | I | A | G | V | G | F | D | I | T | P | K | L | T | L | D | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | G | G | G | S | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||
Sequence | G | Y | R | Y | H | N | W | G | R | L | E | N | T | R | F | K | T | H | E | A | S | L | G | V | R | Y | R | F | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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