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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2mbgA_ | PDB header: protein binding | Chain: A: PDB Molecule: rala-binding protein 1; | PDBTitle: rlip76 (gap-gbd) |
Added to library: Sat Dec 7 08:30:50 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | H | M | P | N | L | K | P | I | F | G | I | P | L | A | D | A | V | E | R | T | M | M | Y | D | G | I | R | L | P | A | V | F | R | E | C | I | D | Y | V | E | K | Y | G | M | K | C | E | G | I | Y | R | V | S | G | I | K | S | K | V | D | E | L | K | A | A | Y | D | R | E | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S | T | T | T | S | T | T | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | T | N | L | E | D | Y | E | P | N | T | V | A | S | L | L | K | Q | Y | L | R | D | L | P | E | N | L | L | T | K | E | L | M | P | R | F | E | E | A | C | G | R | T | T | E | T | E | K | V | Q | E | F | Q | R | L | L | K | E | L | P | E | C | N | Y | L | L | I | S | W | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | S | S | S | S | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | I | V | H | M | D | H | V | I | A | K | E | L | E | T | K | M | N | I | Q | N | I | S | I | V | L | S | P | T | V | Q | I | S | N | R | V | L | Y | V | F | F | T | H | V | Q | E | L | F | G | N | V | V | L | K | Q | V | M | K | P | L | R | W | S | N | M | A | T | M | P | T | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | |
Sequence | P | E | T | Q | A | G | I | K | E | E | I | R | R | Q | E | F | L | L | N | C | L | H | R | D | L | Q | G | G | I | K | D | L | S | K | E | E | R | L | W | E | V | Q | R | I | L | T | A | L | K | R | K | L | R | E | A | |||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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