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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2m88A_ | PDB header: rna binding protein | Chain: A: PDB Molecule: protein nrd1; | PDBTitle: nmr structure of a two-domain rna-binding fragment of nrd1 |
Added to library: Sat May 17 08:29:14 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | P | D | E | L | N | V | S | N | N | P | H | Y | R | P | K | P | V | S | Y | D | S | T | L | P | P | D | H | I | K | V | Y | S | R | T | L | F | I | G | G | V | P | L | N | M | K | E | W | D | L | A | N | V | L | K | P | F | A | E | V | Q | S | V | I | L | N | N | S | R | K | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | F | V | K | V | Y | S | R | H | E | A | E | N | V | L | Q | N | F | N | K | D | G | A | L | P | L | R | T | R | W | G | V | G | F | G | P | R | D | C | C | D | Y | Q | H | G | Y | S | I | I | P | M | H | R | L | T | D | A | D | K | K | W | S | V | S | A | Q | W | G | G | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | G | G | G | T | S | S | G | G | G | T | T | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . |
Sequence | S | G | Q | P | L | V | T | G | I | V | F | E | E | P | D | I | I | V | G | E | G | V | S | S | K | A | I | S | Q | K | M | P | T | D | S | G | R | N | G | P | R | S | G | K | P | |||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | G | G | G | G | T | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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