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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2m7lA_ | PDB header: structural protein | Chain: A: PDB Molecule: calponin homology domain protein, putative; | PDBTitle: alfa-actinin from parasite entamoeba histolytica |
Added to library: Sat Jun 8 09:18:08 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | S | S | S | G | V | T | A | E | Q | M | Q | E | F | K | Q | S | F | D | A | F | D | G | N | H | D | G | I | L | D | K | L | E | F | R | S | C | L | S | S | M | G | L | I | D | I | D | F | T | G | G | E | D | A | Q | Y | D | A | I | Y | N | N | V | T | K | G | E | N | G | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | S | S | B | T | T | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | F | D | N | Y | V | Q | Y | M | K | E | K | N | D | E | N | P | S | P | E | Q | L | N | E | I | F | S | T | I | A | A | G | K | D | S | I | T | E | T | D | M | Q | K | A | G | M | S | A | E | Q | I | E | Y | V | K | A | N | L | P | Q | K | G | D | G | Y | D | Y | A | A | W |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | S | T | T | S | T | T | T | T | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | V | K | T | N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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