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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2m65A_ | PDB header: hydrolase | Chain: A: PDB Molecule: probable dna dc->du-editing enzyme apobec-3a; | PDBTitle: nmr structure of human restriction factor apobec3a |
Added to library: Sat May 25 08:34:19 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | E | A | S | P | A | S | G | P | R | H | L | M | D | P | H | I | F | T | S | N | F | N | N | G | I | G | R | H | K | T | Y | L | C | Y | E | V | E | R | L | D | N | G | T | S | V | K | M | D | Q | H | R | G | F | L | H | N | Q | A | K | N | L | L | C | G | F | Y | G | R | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | B | T | S | S | S | S | S | T | T | S | T | T | B | S | T | T | T | T | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | E | L | R | F | L | D | L | V | P | S | L | Q | L | D | P | A | Q | I | Y | R | V | T | W | F | I | S | W | S | P | C | F | S | W | G | C | A | G | E | V | R | A | F | L | Q | E | N | T | H | V | R | L | R | I | F | A | A | R | I | Y | D | Y | D | P | L | Y | K | E | A | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T | T | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | Q | M | L | R | D | A | G | A | Q | V | S | I | M | T | Y | D | E | F | K | H | C | W | D | T | F | V | D | H | Q | G | C | P | F | Q | P | W | D | G | L | D | E | H | S | Q | A | L | S | G | R | L | R | A | I | L | Q | N | Q | G | N | |||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | B | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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