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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2lemA_ | PDB header: lipid transport | Chain: A: PDB Molecule: apolipoprotein a-i; | PDBTitle: monomeric mouse apoai(1-216) |
Added to library: Thu Jan 10 11:25:34 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | D | E | P | Q | S | Q | W | D | K | V | K | D | F | A | N | V | Y | V | D | A | V | K | D | S | G | R | D | Y | V | S | Q | F | E | S | S | S | L | G | Q | Q | L | N | L | N | L | L | E | N | W | D | T | L | G | S | T | V | S | Q | L | Q | E | R | L | G | P | L | T | R | D | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | W | D | N | L | E | K | E | T | D | W | V | R | Q | E | M | N | K | D | L | E | E | V | K | Q | K | V | Q | P | Y | L | D | E | F | Q | K | K | W | K | E | D | V | E | L | Y | R | Q | K | A | S | P | Q | G | A | E | L | Q | E | S | A | R | Q | K | L | Q | E | L | Q | G | R | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | P | V | A | E | E | F | R | D | R | M | R | T | H | V | D | S | L | R | T | Q | L | A | P | H | S | E | Q | M | R | E | S | L | A | Q | R | L | A | E | L | K | S | N | P | T | L | N | E | Y | H | S | S | A | K | S | H | L | K | S | L | G | E | K | A | R | P | A | L | E | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | S | S | S | T | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | L | R | H | S | L | M | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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