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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2kxsA_ | PDB header: protein binding | Chain: A: PDB Molecule: tight junction protein zo-1, linker, peptide of myocardium- | PDBTitle: zo1 zu5 domain in complex with grinl1a peptide |
Added to library: Sat Apr 2 08:46:51 2011 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | H | S | S | G | L | E | V | L | F | Q | G | P | G | S | T | V | V | A | T | A | R | G | I | F | N | S | N | G | G | V | L | S | S | I | E | T | G | V | S | I | I | I | P | Q | G | A | I | P | E | G | V | E | Q | E | I | Y | F | K | V | C | R | D | N | S | I | L | P | P | L | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | E | K | G | E | T | L | L | S | P | L | V | M | C | G | P | H | G | L | K | F | L | K | P | V | E | L | R | L | P | H | C | D | P | K | T | W | Q | N | K | C | L | P | G | D | P | N | Y | L | V | G | A | N | C | V | S | V | L | I | D | H | F | G | S | G | S | G | V | V | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | B | S | S | S | S | S | G | G | G | G | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | G | V | V | R | R | S | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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